Ohne die Details zu kennen, unterstelle ich unserem Radio mal, dass es kein USB 3.0 kann. Also würden es gute 2.0 Sticks auch tun.
Und ich habe zumindest die Vermutung, dass NTFS schneller indiziert wird als FAT32. Das hatte ich aber nur bei unterschiedlichen Sticks bemerkt und nicht über Kreuz geprüft.
Ansonsten hilft es dem Radio, wenn möglichst wenig verschachtelt wird mit Ordnern und man unnötige Dateien wir nfo und jpg wegreinigt, ganz allgemein.